Коронавирус COVID-19, который впервые появился в 2019 году, продолжает мутировать, и на данный момент уже существует множество штаммов вируса SARS-CoV-2. Когда разные штаммы вызывают заболевание, они могут проходить по-разному и это вызывает много вопросов у медиков и обывателей. В этой статье рассмотрим основные вопросы о генетических вариантах коронавируса.

В микробиологии штаммы называются культурами, выделенными из одного источника, места и времени. Если культуры были выделены из одного источника, но в разное время, то они уже будут принадлежать к разным штаммам. Это понятие часто путают с видами, но микроорганизмы разных штаммов могут принадлежать к одному виду. Однако они все равно будут различаться между собой, но внутривидовые различия не играют большой роли. Коронавирус является ярким примером такой ситуации. Вирус SARS-CoV-2 - это всего лишь один из представителей многочисленного семейства коронавирусов, хотя и виновник последней пандемии COVID-19. За короткую историю пандемии сформировалось несколько штаммов SARS-CoV-2, которые отличаются между собой набором генов - геномом.

Важно знать, что все вирусы, включая SARS-CoV-2, являются не клетками. У них особая структура: вирусная частица (вирион) окружена капсулой и внешней оболочкой. Внутри капсулы находится одна или две молекулы нуклеиновой кислоты, которые являются генетической информацией. Коронавирус является одноцепочечным РНК-содержащим вирусом, геном которого закодирован в единственной молекуле рибонуклеиновой кислоты.

Формирование штаммов происходит благодаря генетическим мутациям, при которых образующиеся дочерние вирусы напоминают материнские, но имеют небольшие генетические отличия. Штаммы коронавируса могут отличаться по скорости распространения и клиническим проявлениям заболевания. Благодаря генетической изменчивости у коронавируса возникает устойчивость к иммунной системе и медикаментозным средствам.

В данной статье мы рассмотрели основные вопросы, связанные с штаммами коронавируса, их опасностью и мерами предосторожности.

В соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения, каждый штамм коронавируса SARS-Cov-2 имеет буквенное обозначение на основе греческого алфавита: от альфа до омикрона. Ранее, штаммы коронавируса получали названия, связанные с местом их первого выявления, например, "британский" или "индийский". Такая классификация, однако, несет в себе негативную окраску, связанную с географической привязкой и может вызвать обвинения в адрес всей страны в распространении COVID-19.

С учетом политкорректности, ВОЗ предложила новую номенклатурную классификацию, основанную на греческом алфавите. При этом, старые названия штаммов коронавируса все еще могут использоваться в медицинских исследованиях. Таким образом, к началу 2022 года количество штаммов коронавируса, которые отличаются от первого, китайского варианта, составило 13.

Однако, даже в новой классификации можно обнаружить нюансы. Наиболее известным сейчас является штамм "омикрон". В его названии пропущены буквы ню и кси, которые должны были предшествовать букве омикрон. По мнению экспертов, букву ню пропустили, чтобы не вызывать панику среди жителей англоязычных стран, где слово "new" (англ. новый) звучит так же, как и "ню" (греч. ню). От буквы кси также отказались, поскольку она связана с китайской фамилией Си, которая носится лидером этой страны Си Цзиньпинь. Некоторые источники ранее бездоказательно обвиняли Китай в создании и распространении коронавируса, и ассоциация названия штамма с фамилией главы государства могла бы инициировать антикитайские настроения.

Опасные штаммы коронавируса COVID-19 можно определить по нескольким критериям. Во-первых, опасные штаммы обладают высокой контагиозностью - они легко передаются от человека к человеку. Во-вторых, эти вирусы имеют высокую вирулентность и могут вызывать патологические изменения в тканях организма даже в малых количествах. В-третьих, опасные штаммы характеризуются тяжелым течением коронавирусной инфекции и высокой вероятностью опасных осложнений и неблагоприятного исхода болезни. В-четвертых, возбудители этих штаммов устойчивы к действию вакцин и лекарств.

Организация ВОЗ подготовила список вариантов коронавируса, вызывающих опасения, который получил название VOC (Variants of Concern). В список вошли четыре коронавирусных штамма: альфа-штамм коронавируса, который был обнаружен в Великобритании, штамм из Южной Африки под названием бета-штамм, бразильский гамма-штамм и индийский дельта-штамм. В ноябре 2021 года ВОЗ дополнила список новым штаммом - омикрон. Также был разработан список генетических вариантов, вызывающих интерес (VOI - Variants of Interest), в который вошли штаммы с мутациями генома, которые в будущем могут привести к изменению эпидемиологических характеристик коронавируса. В список VOI вошли штаммы: эта-, йота-, каппа- и лямбда-штаммы. Если количество заболевших этими штаммами возрастет, ВОЗ переведет их из VOI в категорию VOC.

Как проявляется COVID-19, вызванный дельта-штаммом, и в чем его отличие от классического коронавируса?

Дельта-штамм коронавируса, выявленный в Индии, имеет более короткий минимальный инкубационный период, чем классический коронавирус, изначально обнаруженный в городе Ухань. Максимальный период инкубации по-прежнему составляет две недели.

Помимо стандартных симптомов COVID-19, таких как кашель, лихорадка, потеря обоняния и вкуса, дельта-штамм вызывает симптомы, характерные для расстройства желудочно-кишечного тракта, такие как тошнота, рвота и диарея. При этом встречаются боли в голове и горле. Самой уязвимой группой при заражении дельта-штаммом является молодежь в возрасте от 14 до 29 лет.

Источник: Роспотребнадзор. 2021. "Дюжина вопросов о «дельта»-штамме". Доступно по ссылке.

Какова опасность дельта-штамма коронавируса?

Новая индийская вариация коронавируса отличается от классической своей высокой инфекционной способностью. Если в случае COVID-19 каждый пациент заражал от 2 до 3 человек, то в случае дельта-штамма этот показатель возрастает до 5-8. Привнесла ли новая форма изменения в клинический характер заболевания? Индивидуальные особенности клинического течения могут играть роль в увеличении количества заражений. Так, высокая температура часто предупреждает о заражении, но в случае дельта-штамма этот симптом может проявиться не сразу, что делает труднее обнаружить источник инфекции.

Количество вирусов в организме с штаммом дельта-плюс значительно выше по сравнению с классическим COVID-19, поэтому выработка антител требует больше времени и усилий. Усложняется лечение и резко растет вероятность госпитализации пациента. Штамм дельта плюс коронавируса, который является новой модификацией, особенно тяжело протекает и грозит значительным угрозам.

Какие отличия есть у британского варианта коронавируса от SARS-CoV-2?

Симптомы британской коронавирусной инфекции практически не отличаются от классической китайской формы. Однако, различия все же существуют – альфа-штамм более часто проявляется болями в горле и кашлем, чем стандартный SARS-CoV-2 на 1/3. Тем не менее, потеря обоняния встречается реже всего – у 39% больных альфа-штаммом.

Кроме того, альфа-штамм на 90% более заразен, чем стандартный SARS-CoV-2. В связи с этим, болезнь протекает более тяжело, частота госпитализации при инфицировании альфа-штаммом намного выше – на 64%. Это существенно увеличивает риск плохого исхода. Тем не менее, в России количество людей, заразившихся британским вариантом коронавируса, не очень высоко. Ученые отмечают также существование других вариантов вируса - бета, гамма и дельта, которые также имеют свои особенности и отличия. (Источник: ЭЛ КЛИНИКА)

Штамм омикрон: что мы о нем знаем?

В ноябре 2021 года был обнаружен еще один штамм коронавируса, происходящий из Южной Африки. Он быстро распространился по всему миру, вызывая заболеваемость у многих людей. Штамм омикрон очень заразен и ежедневно устанавливает новые рекорды по числу заболевших. В отличие от первоначального COVID-19, который преимущественно поражал пожилых людей и тех, у кого имеются сопутствующие заболевания, новый штамм также инфицирует детей.

Однако, пока нет единого мнения насчет того, насколько тяжело развивается заболевание и какова вероятность плохого исхода. Согласно лабораторным исследованиям, омикрон-штамм реже проникает в легкие, в отличие от первоначального варианта коронавируса, и чаще поражает носоглотку. Именно из этой части тела вирус проще распространяться воздушно-капельным путем, что может быть одной из причин высокой заболеваемости. В то же время, количество смертельных случаев остается на стабильно низком уровне, составляя около 0,1-0,2% от числа заболевших.

Биолог Константин Северинов дал ответы на 10 основных вопросов о штамме омикрон. Источник: https://trends.rbc.ru/.

Как определить заражение конкретным вариантом коронавируса?

Каждый штамм вируса имеет свои характеристики. Например, один генетический вариант вызывает более легкую форму болезни, а другой может приводить к более тяжелым последствиям. Некоторые штаммы относятся к возрастным категориям, одни поражают пожилых людей, в то время как другие — всех возрастов.

Хотя различия в штаммах могут определяться поражением легких, носоглотки или желудочно-кишечного тракта, не следует полагаться на эти особенности.

Чтобы точно определить генетический вариант SARS-CoV-2, необходима объективная диагностика, такая как полимеразная цепная реакция (ПЦР) методом секвенирования. При этом изучают последовательность генов в молекулярной цепи. Хотя для проведения ПЦР необходимо сложное оборудование, процедура является довольно простой: мазок берется из носоглотки и ротоглотки. И это можно сделать как в условиях медицинского центра, так и на дому. Результат будет доступен уже через несколько часов, а их достоверность приблизительно равна абсолютной. Поэтому ПЦР признается "золотым стандартом" диагностики COVID-19.

Существует первая отечественная тест-система для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2. Детальнее о ней можно прочитать на информационном портале о генетике GENETICS. URL: https://genetics-info.ru/.

Вопрос о том, сохраняется ли иммунитет у человека после перенесенного коронавируса к другим его штаммам, остается открытым. После первого заражения в крови образуются антитела, которые пытаются уничтожить новые заражения. Однако возможно, что мутировавший коронавирус может плохо связываться с антителами, поэтому иммунная система может уничтожать не все, а лишь некоторые штаммы вируса.

Кроме того, временной фактор тоже имеет огромное значение. Со временем количество циркулирующих антител в крови уменьшается. Это означает, что эффективность защиты от последующих инфекций также может быть разной, в зависимости от времени, когда повторное заражение произошло, состояния иммунитета и вида мутации. В общем, ответ на вопрос о том, сохраняется ли иммунитет после перенесенного коронавируса, не является однозначным.

Фото: freepik.com